《 Starlink Battle for Atlas 》的 副任務 （即是Side quest），無論是任何版本均是共通，玩家可以使用任何角色和星艦進行，完成Side quest可以獲得改造模組，即使沒有完成副任務，也不會影響主線故事。在主線任務中，玩家為二分點號「核心系統」的「守衛者解碼」升級後就會出現「聖格蘭特的秘密」的副任務，玩家只需用十字鍵選擇任務，就可以依指示進行，這項任務會需要隨著主線任務的進度才可持續完成。
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聖格蘭特的秘密
任務1. 挖掘資料
內容：前往凱端特星的衝擊地點，尋找資料罐，觀看各STARLINK成員的背景資料。合共七個。
任務2. 秘密同僚
內容：前往維勒斯星，到索恩博士所在之處，跟博士交談後前往第二地點，取下拱頂石（先拔起3個藤蔓球莖，然後到底部用冰武器把烈焰異化新星破壞，就可打開通道）。
任務3. 締造歷史
內容：把拱頂石放在第一地點的高處，此時先用冰武器把卡住浮空岩的烈焰異化新星破壞，然後最好把星艦的操作提至最高，這樣就可以跳得更高，較為容易帶著拱頂石到高處。
任務4. 現存群族
內容：前往指定的未知星球（奈克融星），到達索恩博士所在之處，跟博士交談後，依指示啟動至尊機的雷射，由於需要帶聚焦水晶到高處，所以先把星艦的操控提升至最高點（約200），以便跳到高處。利用至尊機的雷射破壞至尊機的裝甲，取下至尊機的核心，交給博士，再把3台完美獨眼機器人擊倒。
任務5. 最後的話語
內容：前往凱端特星的指定地點，回收資料罐後看過梅森記錄便正式完結。
