SD GUNDAM GGENERATION CROSSRAYS 擁有五部 隱藏機體 ，這五台機體全都不屬於《GUNDAM W》、《GUNDAM SEED》、《GUNDAM OO》和《鐵血之孤兒》的系列，而是來自《SD GUNDAM外傳》和《BUILD FIGHTER》系列的機體，以下是各機體的 取得方法。
GUNDAM FENICE RINASCITA（ガンダムフェニーチェリナーシタ）
取得方法：完成任務「流星的試練」，把《GUNDAM W》世界所有部隊擊破。
GALBALDY REBAKE（ガルバルディリベイク）
取得方法：完成任務「野生的試練」，把《鐵血之孤兒》世界所有部隊擊破。
GUNDAM OO SKY（ガンダムダブルオースカイ）
取得方法：完成任務「革新的試練」，把《GUNDAM OO》世界所有部隊擊破。
STAR BUILD STRIKE GUNDAM（スタービルドストライクガンダム）
取得方法：完成任務「自由的試練」，把《GUNDAM SEED》世界所有部隊擊破。
騎士SUPERIOR DRAGON（騎士スペリオルドラゴン）
取得方法：完成任務「超級最終試練」，當完成擊破四個世界的所有部隊（包含隱藏部隊），就可完成這個任務。