當玩家成為《 集合啦 動物森友會 》的島民後，就要努力好好還債，從而推進遊戲發展。雖然玩家在島上是相當自由，但事實上若不還債，遊戲亦不會有任何進展， 遊戲流程 大致如下文，玩家可以參考。隨著島的發展，玩家可以做得更多，好像設計自己的家、協助豐富博物館等等。
1）完成角色設定，包括：選擇所屬地（南、北半球）、角色樣貌、性別、姓名等。
2）進入小島後完成基礎教學，之後回到帳篷睡一晚，此時遊戲時間將與現實時間同步。
3）此時玩家需要償還第一筆貸款（5000哩數），完成多個挑戰就可完成。完成第一筆貸款，就可以建自己的房子，隨後就是第二筆貸款（98000鈴錢），玩家可以透過賣出拾得的素材（包括昆蟲、魚類、生果等），慢慢在ATM中償還。
4）此時可以利用作業台來製作物品，製作魚竿和捕蟲網，抓住5種生物，交給狸克會觸發館長傅達任務，此時狸克會停止接收生物。
5）在傅達來之前，先為他安排好帳篷位置（最好選一個比較方便的位置，因為這裡會是博物館的所在地）
6）到第二天傅達來到後，會把撐杆跳竿子和鏟子的製作方案送給玩家，這時可以利用撐杆跳竿子渡河，然後收集15個不同生物（昆蟲、魚）或化石，交給他之後可以建造博物館。
7）博物館建造之後會有兩天左右不能繳納展品，玩家可以把新物種放在自己家中，待博物館開業後再去捐贈。
8）與服務台的豆狸交談，他會希望你可以幫他收集30個木材、30個硬木材、30個軟木材以及30個鐵礦石，用作建立商店，三種木材可以用石斧砍樹取得（隨機），鐵礦石需要用鐵鍬或者斧子砍路邊的石頭（注意：吃水果後不要去砍，否則會直接把石頭砍碎）。如果急於尋找，可用2000哩數換取「哩數旅行券」前往素材島收集。
9）把素材交付後玩家要選擇一個商店的位置，商店會在完成選址後第二天開始營業，營業時間為早8：00~晚10：00。
10）商店建成後，可以用ZR表現表情，找狸克時他會告訴你要有3個新的居民搬來，這裡需要你説明他們選擇居住的位置，以及製作相應的傢俱擺設並交給你一份新的傢俱製作方案，安置好三個位置後可以通過與房前的綠色箱子對話來瞭解所需要的物品，收集材料進行製作，此時會出現花朵類的素材，而花朵只會在島的高層出現，因此狸克會給你一份梯子的製作方案，利用梯子就可到高層地區。當三個房子的需求全部完成後三個居民會按順序搬來，等待他們全部搬來即可。
11）此時如博物館有一定程度的展品，傅達會聲稱想收集美術品，第二天，商人狐利會出現在島上，找到他並和他對話，花費4980購買到一件美術品。把它送到博物館，傅達便會通知玩家博物館將在次日進行改造。當博物館擴建完成後，商人狐利便會不定期來到島上，玩家要先找到他，讓他帶你去船裡。狐利商店裡會售賣各類工藝品，每件售價4980鈴錢。但當中也有贗品（假），只有真品可以交給傅達。
12）當償還全數第二筆貸款後，可以申請擴建房屋，擴建費用為198000鈴錢。這時狸克會主動升級玩家的房子，接著的收費是348000鈴錢。只要再償還全數，就可以進一步升級房屋，第二天亦會擴建完成，而貸款將會不斷順序上升，548000鈴錢、758000鈴錢、1248000鈴錢和2498000鈴錢，詳細如下：
| 等級 | 擴建內容 | 收納數 | 款項 |
| 1 | 建立小屋 | 80 | 98000 |
| 2 | 房間變得較闊 | 120 | 198000 |
| 3 | 追加房間 | 240 | 348000 |
| 4 | 追加左側房間，可改郵箱及屋頂 | 320 | 548000 |
| 5 | 追加右側房間，可改大門外觀 | 400 | 758000 |
| 6 | 追加2樓，可改外駐及移動郵箱 | 800 | 1248000 |
| 7 | 追加地下室，1次免費全改動 | 1600 | 2498000 |
13）當三個新村民搬來後，狸克會通知玩家「服務處」會進行升級，因此即使進入第二天，ATM機和垃圾箱都是無法使用。
14）第二日「服務處」升級完成後，NPC西施惠會加入，她的功能是自訂一些音樂、旗幟等，旁邊的狸克會追加公共建設功能，可以選擇橋樑或是一些斜坡設施，在指定位置安放捐款箱，通過玩家和NPC的捐款來製作對應的設施。
15）之後狸克會依賴玩家（需主動跟狸克交談），尋找到一個地方製作露營地，決定好後第二天會建成，這個露營地是會不時出現一些新角色，玩家可以決定是否讓他們成為島上的常駐居民。露營地建好後，隔天會搬來第一個角色，露營地的角色都是隨機生成，同時第一個必須選擇讓他留下來。
16）在「服務處」升級後，亦會進入新階段，分別會在廣場出現流動服裝店的絹兒、在島上出現專門賣地板、賣大頭菜的曹賣和壁紙的駱嵐，還有專門收集魚類的俞司延等等，玩家可以從他們身取得一些家具。另外，晚上亦會隨機出現流星，讓玩家可以做的事情更多。
>>有關服裝店、流星、大頭菜等資訊<<
17）之後遊戲會增加讓玩家自己售賣土地的選項，至此玩家的基本任務就完成，後續只要通過裝飾小島並且讓島上居住滿10個居民後，就要讓小島擁有三星評價。
18）當小島達到三星評價，K.K會來舉辦演唱會，隨後主線劇情就此結束，開放自由「開發」島嶼模式。
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